墨脱实际上位于西藏东南部，地处雅鲁藏布江下游，南与印度交界，总面积有3.4万平方公里。
虽然身处平均海拔为4000多米西藏高原，但墨脱县的平均海拔是1200米，北高南低，北部最高的是海拔7756米的南迦巴瓦峰和海拔是7294米的加拉白垒峰，南部最矮的是海拔仅115米的巴昔卡，落差超过7000米。
和印度交界
墨脱县，隶属于西藏自治区林芝市辖县，位于西藏东南部，地处雅鲁藏布江下游、喜马拉雅东段与岗日嘎布山脉的南坡，东邻察隅县，南与印度交界（部分区域在藏南地区），西接米林县、隆子县、错那县，北连波密县。
墨脱县在祖国西南边陲，西藏高原的东南部，在这约一万平方公里的地域里发育、繁衍了丰富多彩、千姿百态、气象万千的自然资源。
墨脱到达旺有三条线路，最近的一条有约为768公里左右，最远的一条公路有约为985公里左右，中间的一条公路有约为816公里左右。