一般情况下，如果今天住院并且今天下午才交医保，那么可能存在一些不确定因素，具体能否报销要视具体情况而定。

首先，不同地区的医保政策可能有所不同。一些地区可能会规定必须在住院前一定时间内缴纳医保费用，才能享受医保报销。如果所在的地区有这样的规定，那么在今天住院并且今天下午才交医保的情况下，可能无法享受医保报销。

其次，即使所在的地区没有这样的规定，也需要确保所缴纳的医保费用已经生效。通常情况下，医保费用缴纳后会有一定的生效期，需要在生效期内完成住院费用的结算，才能享受医保报销。如果所缴纳的医保费用尚未生效，那么也可能无法享受医保报销。

此外，还需要注意的是，不同医院对于医保报销的流程也可能有所不同。建议在办理住院手续时，向医院的工作人员咨询医保报销的具体流程，以确保能够顺利地享受医保报销。

综上所述，今早上住院今天下午交医保能否报销，需要具体情况具体分析。建议及时咨询所在的地区医保部门或所在医院的工作人员，以了解更详细的医保报销政策和流程。